13 Lecture 12 - Sequence analysis in R III
강의 노트 Lecture note
R을 이용한 서열분석 세 번째 시간입니다. 지난 두 시간동안 NCBI 데이터를 활용하기 위한 reutils 패키지 사용법과 genbank 파일을 파싱하고 그 안에 있는 feature 를 visualization 하는 방법을 배웠습니다. 이번 시간에는 NCBI에서 특정 서열들을 다운받아 이들의 alignment 와 visualization 등에 관한 내용을 강의하도록 하겠습니다. 필요한 패키지들은 대략 다음과 같습니다.
- Biostrings
- DECIPER
- dplyr 등..
실습 데이터 다운로드